The SERA genes completed Statistics 246 Week 7 Spring 2006 Lecture 2 SERA alignment around the Cys Ser site here 31 50 49 48 47 46 45 44 43 42 41 40 39 38 37 36 35 34 33 32 31 30 29 28 27 26 25 24 23 22 21 20 19 18 17 16 15 14 13 12 11 10 9 8 7 6 5 4 3 2 1 Seq name Pv3 Pv5b Pv5a Pv4 Pv1 Pk3 Pk4 Pv2 Pk5 Pf2 Pf4 Pf3 Pf1 Pf5 Pf9 Pk1 Pv6 Pf7 Pk2 Pf6 Pvi1 Py3 Pvi2 Pc1 Py4 Py1 Pvi3 Py2 F F F Y H F F F F Y Y Y F F Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y F C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C N N N N N N N N N N N N N N N N N N N N N N N N N N N N D D D D D Y Y E E R H N S K D Y Y N N Y Y Y K K K N N N D E D E D D D D D E E D S E D E E E E E D E D D D E E D Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y F Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y F C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C D D D D D D D D N N N N N N N D D D D N N D D D D D D D R R R R R R R R R R R W R R R R R R R R R R R R R R R R A A A W A T T W W L L S L L W W W W W W W W W W W L L L K K K K K K K K K K K K K K K K K K K R Q Q K Q Q K K K D D D D D D D D D D D D D D N D D D D D D D D D D D D D T S S S T T T K R H H K E E E K K K K K K K K K K N K N S S S S S S S S N N N N N N N T T T T T T T T T T N T N S S S S S S S S S N N S N N N S S G S S S S S S S S S S C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C V I M V M L L F F I I I I I I I I I I I I I L M I I I I A A A A A S S S A S S S S S S S S S S S S S S S S S S S K K K K K K K S R K K K K N K N N K N Q N N N N N K K N I I I I I I M I I I I I I L I I I I I I I I I I I I I I E E E E E E E E E N N N Q Q G E E E E E D D E E E D N D V A A V V V V T T V V V I V V V V V V V V V V V V V V V Q G G E E Q H E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E D D D D D D D E E D D D D D D E E E E E E E E E E E D E Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q G G G G G G G G G K K K G G G G G G G G G G G G G G G G D D D A D N N N N N N N N N N N N N D N N N E E E N N N C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C A S S S A A A N N A A A A D A G G G G G S S G G G A A A T T N N T T T L L L L L I T S L L L L L L L V V I T T T S S S S S S S S S S S S S S S C C C C C C C C C C S S S W W W W W W W W W W W W W W W W W W W W W W W W W W W W L L L L L L L L L A A A I I A I V I I I L L V V I L L I F F F F F F F F F F F F F F F F F F F F F F F F F F F F A A A A A A A T A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A S S S S S S S S S S S S S S S S S S S S S S S S S S S S K K K K K K K K K I K K K K K K K K K K K K K K K K K K V V V V M L L T L Y Y Y Y Y L L L L L L L L L L L F L F H H H H H H H H H H H H Y H H H H H H H H H H H H H H H L L L L L L L …
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